Service Offering: Digital Biobank (open source) 1

Alle klinischen Open Source Daten an einem Ort

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Was ist die Open Source Digitale Biobank?

Alle aktuell erhältlichen klinischen Open Source Daten an einem Ort – das ist unser Ziel, um Entwickler auf der Suche nach relevanten Daten für das Training von KI-basierten Innovationen zu unterstützen. Derzeit finden Sie hier eine Übersicht zu Daten der im Folgenden aufgeführten Bereiche. Sollten Sie Interesse an weiteren Bereichen haben, kontaktieren Sie uns gerne. Wir arbeiten kontinuierlich an einer Erweiterung.

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Warum Open Source Daten?

Open Source Daten, sind eine schnelle und kostengünstige Möglichkeit für das Training von KI. Auch bei komplexen Anwendungen, können sie zur anfänglichen Überprüfung der Machbarkeit verwendet werden.

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Für wen eignen sich Open Source Daten?

Open Source Daten eignen sich besonders für Projekte, mit geringen kundenspezifischen Anforderungen und geringem Budget. Bei Fragen helfen wir Ihnen gerne weiter. Kontaktieren Sie uns!

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Was sollte man beachten?

Unbedingt zu beachten sind die jeweiligen Nutzungsbedingungen (Terms of use). Die verschiedenen Nutzungsbedingungen wie beispielsweise CC BY 3.0 werden auf der jeweils verlinkten Website genauer erläutert.

Auf der Suche nach etwas Speziellem?

Mit unserer digitalen Biobank stellen wir annotierte klinische Daten passend für Ihr Projekt bereit.

Frei verfügbare Prostata-Datensätze

NameModalitätAnzahl der PatientenAnzahl der ScansFormatNutzungsbedingungen
TCIA "Prostate-MRI"MR (with some PET/CT)2622.036DICOMCC BY 3.0
TCIA "Prostate-3T"MR (T2W)641.258DICOMCC BY 3.0
TCIA "PROSTATEx"MR (T2W, PD-W, DCE, DW)346309.251DICOMCC BY 3.0
TCIA "NaF Prostate"PET/CT964.535DICOMCC BY 3.0
TCIA "PROSTATE-DIAGNOSIS"MR (T1, T2, DCE)9232.537DICOMCC BY 3.0
TCIA "Prostate Fused-MRI-Pathology"MR (T1, T2, DW, DCE)
2832.508DICOMCC BY 3.0
TCIA "The Cancer Genome Atlas Prostate Adenocarcinoma (TCGA-PRAD)"CT, PT, MR1416.790DICOMCC BY 3.0
TCIA "Pelvic-Reference-Data"CT5813.644DICOMCC BY 3.0
Initiative for Collaborative Computer Vision BenchmarkingMRI (T2, DCE, DWI, ADC)12DICOMCC BY 4.0
Harvard NCIGT "Prostate Project"MR230PNGno information
TCIA "QIN PROSTATE"MR (T1/T2, DW, DCE)2225.981DICOMlimited access

Frei verfügbare Wirbelsäulen-Datensätze

NameModalitätAnzahl der PatientenAnzahl der ScansFormatNutzungsbedingungen
UCI Machine Learning Repository Vertebral Column Data SetCT310with citation
SpineWeb "IVDM3Seg"MRI12NIFTIdata upon request, citation, will supply the data provider with copies of publications.
SpineWeb "xVertSeg challenge"

CT (lumbar)25MHDPDDL

Mendeley Lumbar Spine MRI DatasetMR51548.345DICOMCC BY 4.0
DeepSpine VerSe19CT160NIFTI
NIH "DeepLesion" (not spine specific, only key slices + context >60mm)CT4.42732.120PNGunrestricted
TCIA "LIDC-IDRI"CT thorax (+ partial CR/DX)1.006243.185DICOMCC BY 3.0

Frei verfügbare Gehirn-Datensätze

NameModalitätAnzahl der PatientenAnzahl der ScansFormatNutzungsbedingungen
TCIA "CPTAC-GBM"CR, CT, DX, MR, NM, SC63154.476- DICOM
- SVS (Patho)
CC BY 3.0
TCIA "ACRIN-FMISO-Brain"CT, MR, PET45671DICOMCC BY 3.0
TCIA "QIN-BRAIN-DSC-MRI"MR49116.778DICOMCC BY 3.0
TCIA "Brain-Tumor-Progression"T1w (pre and post-contrast agent), FLAIR, T2w, ADC, DSC208.798DICOMCC BY 3.0
TCIA "1p19qDeletion"MR15917.360DICOMCC BY 3.0
TCIA "Ivy Glioblastoma Atlas Project (Ivy GAP)"MRI, CT39846.743DICOMCC BY 3.0
TCIA "RIDER NEURO MRI"MRI (T1, T2, DCI, DTI,
contrasted 3D FLASH/FLAIR)
1970.220DICOMCC BY 3.0
TCIA "The Cancer Genome Atlas Low Grade Glioma (TCGA-LGG)"CT, MR199241.183DICOMCC BY 3.0
TCIA "The Cancer Genome Atlas Glioblastoma Multiforme (TCGA-GBM)"MR262481.158DICOMCC BY 3.0
TCIA "REMBRANDT"MR130110.020DICOMCC BY 3.0
UCLH Stroke EIT DatasetCT, CT Angio, MR23NIFTI CC BY 4.0
Brain-developement "IXI DATASET"T1, T2, PD, DW600NIFTI CC BY 3.0
Harvard NCIGT "Intra-operative MRT Glioma Resection" & "Neuro_MRT_g" & "NeuroMRT"MRI (T1, T2, SPGR)131DICOM (IMA)public access
OASIS (1-3)MRI (+PET)1550citation, provide information on use of OASIS data upon request. If PET-Data is used, must be submitted to "Avid Radiopharmaceuticals" for review!
OpenfMRIPDDL
ADNI - Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative MR, PETfor the purposes of scientific investigation, teaching, or planning clinical research studies, IRB compliance.
CQ500CT nativ193.317DICOM CC BY-NC-SA 4.0
Johns Hopkins University Data Archive Head CTCT35DICOM CC BY-NC-SA 4.0
BraTS Multimodal Brain Tumor Segmentation Challenge CC BY-NC 3.0

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